对每个基因集的 ES 进行归一化以考虑该基因集的大小，从而产生归一化的富集分数 (NES)。根据各自的 NES 评估 MAPK 信号和 PI3K-Akt-mTOR 信号的活性。 基底肿瘤与所有其他肿瘤之间的通路富集分析 使用学生t检验在基底肿瘤和其他肿瘤之间进行整体蛋白质组数据的差异表达分析。P值通过 Benjamini-Hochberg 程序进行调整，调整后的P值（FDR，也称为q值）< 0.05 则认为特
征具有显着性。最后，在Basal组中，我们分别鉴定了总共313个上调至少国家电子邮件列表两倍的蛋白质和113个下调至少两倍的蛋白质，其同源基因使用超几何检验分别与KEGG通路富集分析进行比对。通过 stats R 包中提供的“Phyper”函数。带P 的路径-值<0.05被认为受到显着调节。对于上调和下调蛋白的 KEGG 富集分析，我们分别列出了三个特征途径。 应用单
白质组亚型之间丰度显着差异（ P < 0.05）的磷酸肽然后在基底肿瘤和其他肿瘤之间进行比较。进一步选择Basal组中FC > 1.2的磷酸肽，将其同源基因纳入其中，以使用Reactome数据库推导出富集的通路。P值是通过基于超几何检验的 R 函数“Phyper”函数计算的。 鉴定Basal亚型的潜在药物靶点 首先，我们尝试鉴定Basal亚型的特征蛋白。基底肿瘤和
发表于 2023-7-17 12:06:59
